1、丟失發票聯的處理：使用專用發票抵扣聯作記賬憑證，使用專用發票抵扣聯復印件留存備查，其他無需作單獨處理。　　

2、丟失抵扣聯的處理：使用專用發票發票聯復印件留存備查，其他無需作單獨處理。
　　3、丟失發票聯和抵扣聯的處理：開票方需要復印發票復印件，并由開票方稅局開具《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》；再由收票方主管稅務機關審核同意后，才可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。
　　4、丟失記賬聯的處理：一般來說，如果發票開出后尚未寄出，可（開票單位）將發票的發票聯復印，作為記賬憑證;若已寄出，則從金稅卡中重新打印一次，作為記賬憑證。無需稅局和收票單位作任何處理。
　　5、丟失全聯次處理：一般是結合3和4的處理方式合并進行處理。

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