銀行匯票結算經過承匯、結算、兌付和結清余額四個步驟，具體結算程序為：

　　(1)銀行匯票的申請。申請人需要使用銀行匯票，應向銀行填寫一式三聯的“銀行匯票申請書”。第一聯是存根，由申請人留存，第二、三聯是銀行內部使用的憑證。申請人在填寫時，要用雙面復寫紙套寫(其他多聯結算憑證會寫要求與此相同)，按銀行匯票申請書所列項目逐項填明收款人名稱、匯票金額，申請人名稱、申請日期等事項，并在第二聯“申請人蓋章”處簽章，簽章為其預留銀行的簽章。申請人和收款人均為個人，需要使用銀行匯票向代理付款人支取現金的，申請人須在銀行匯票申請書上填明代理付款人名稱，在“匯票金額”欄先填寫“現金”字樣，后填寫匯票金額。申請人或者收款人為單位的，不得在銀行匯票申請書上填明“現金”字樣。申請人填妥后將銀行匯票申請書二、三聯連同所匯款項一并送交銀行。

　　(2)出票。出票銀行對銀行匯款申請書的內容和印鑒驗證無誤，收妥款項后簽發銀行匯票，并且壓數機壓印出匯票金額。銀行匯票一式四聯：第一聯卡片，由出票銀行留存;第二聯匯票;第三聯解訖通知，匯票聯和解訖通知由出票銀行一并交給申請人，申請人便可持此兩聯銀行匯票到異地辦理支付結算或支取現金，缺一不可;第四聯是多余款收賬通知，出票銀行將銀行匯票金額結算后將此聯交申請人。

　　銀行簽發轉賬銀行匯票，不得填寫代理付款人名稱。簽發現金銀行匯票，申請人和收款人必須均為個人，收妥申請人交存的現金后，在銀行匯栗“出票金額”欄先填寫“現金”字樣，后填寫出票金額，并填寫代理付款人名稱。中請人或者收款人為單位的，銀行不為其簽發現金銀行匯票。

　　(3)兌付。

　　1)在銀行開立存款賬戶的收款人受理銀行擴票后向開戶銀行提示付款時，應在匯票背面“持票人向銀行提示付款簽章”處簽章，簽章須與預留銀行簽章相同，并填寫一式兩聯進賬單，連同銀行匯票和解訖通知一并送交開戶銀行，銀行審查無誤后辦理轉賬。

　　2)未在銀行開立存款賬戶的個人持票人(或收款人).可以向選擇的任何一家銀行機構提示付款。提示付款時，應在匯票背面“持票人向銀行提示付款簽章”處簽章，并填明本人身份證件名稱、號碼及發證機關，由其本人向銀行提交身份證及其復印件。銀行審核無誤后，將其身份證復印件留存備查，并以持票人的姓名開立應解匯款及臨時存款賬戶，該賬戶只付不收，付完清戶，不計付利息。

　　(4)背書。背書是指忙票持有人將票據權利轉讓他人的一種票據行為。其中所謂的票據權利是指票據持有人向票據債務人(主要是指票據的承兌人，有時也指票據的出票人、保證人和背書人)直接請求支付票據中所規定的金額的權利。通過背書轉讓其權利的人稱為背書人，接受經過背書匯票的人就被稱為被背書人。

　　按照現行規定，填明“現金”字樣的銀行匯票不得背書轉讓。區域性銀行匯票僅限于本區域內背書轉讓。銀行匯票的背書轉讓以不超過匯款金額為準。未填寫實際結算金額或實際結算金額超過忙款金額的銀行匯票不得背書轉讓。在背書時，背書人必須在銀行匯票第二聯背面“背書”欄填明其個人身份證件及號碼并簽章，同時填明被背書人名稱，并填明背書日期。被背書人在受理銀行匯票時，除按前述收款人要求對匯票進行審查外，還應審查銀行匯票是否記載實際結算金額，有無更改，其金額是否超過匯款金額;背書是否連續，背書人簽章是否符合規定，背書使用粘單的是否按規定簽章;背書人為個人的其身份證是否真實等。被背書人按規定在匯票有效期內，在被背書人一欄簽章并填制一式兩聯進賬單后到開戶行辦理結算，其會計核算辦法與一般銀行匯票收款人相同。

　　(5)結算與退款。兌付銀行按實際結算金額辦理人賬后，將銀行匯票第三聯解訖通知傳遞給匯票簽發銀行，簽發銀行核對后將余款轉入匯款人賬戶，并將銀行匯票第三聯多余款收賬通知轉給匯款人，匯款人據此辦理余款人賬手續。匯款人收到通知后借記“銀行存款”賬戶，貸記“其他貨幣資金——銀行匯票”賬戶。

　　匯款單位因匯票超過了付款期限或其他原因沒有使用匯票款項時，可以分情況向簽發銀行申請退款：

　　1)在銀行開立賬戶的匯款單位要求簽發銀行退款時，應當備函向簽發銀行說明原因，并將未用的“銀行匯票聯”和“解訖通知聯”交回匯票簽發銀行辦理退款。銀行將“銀行匯票聯”和“解訖通知聯”和銀行留存的銀行匯票“卡片聯”核對無誤后辦理退款手續，將匯款金額劃入匯款單位賬戶。

　　2)未在銀行開立賬戶的匯款單位要求簽發銀行退款時，應將未用的“銀行匯票聯”和“解訖通知聯”交回匯票簽發銀行，同時向銀行交驗申請退款單位的有關證件，經銀行審核后辦理退款。

　　3)匯款單位因缺少“解訖通知聯”而向簽發銀行申請退款時，應將“銀行匯票聯”退給匯票簽發銀行，并各函說明短缺的原因，經簽發銀行審查同意后于銀行匯票提示付款期滿一個月后辦理退款手續。