企業所得稅核定征收辦法規定，應稅收入額乘以應稅所得率，計算出應納稅所得額，再用應納稅所得額乘以適用稅率，計算出應繳納的企業所得稅。
　　稅務機關對納稅人實施核定征收企業所得稅，對納稅人來說就意味著按收入乘以“附征率”。假如對當地某行業的應稅所得率確定為10%，就等于“附征率”為2.5%。因此，無論是稅務機關，還是納稅人，對核定征收企業所得稅的企業，只要將計稅收入判定正確，就不會出現問題。
　　《國家稅務總局關于企業所得稅核定征收若干問題的通知》(國稅函〔2009〕377號)規定，“應稅收入額”等于收入總額減去不征稅收入和免稅收入后的余額。其中，收入總額為企業以貨幣形式和非貨幣形式從各種來源取得的收入。
　　關于核定征收企業所得稅的企業確定收入問題，企業所得稅法實施條例第十二條至二十五條規定得十分詳細，這里不再贅述。但要說明的是，如權益性投資收益，雖然是收入總額組成部分，但它屬于“免稅收入”，應當減除;如果取得財政性資金，首先要按《財政部、國家稅務總局關于專項用途財政性資金企業所得稅處理問題的通知》(財稅﹝2011﹞70號)文件進行判定，如果滿足該文件規定的條件，屬于“不征稅收入”的，也要減除。如果不滿足條件，則屬于計稅收入。
　　現在有些核定征收企業所得稅的企業進行“營改增”，在繳納增值稅時，對小規模納稅人按3%的稅率繳納增值稅，計算方法為銷售額=含稅銷售額÷(1+征收率)，這時，產生的增值稅稅額已經不包含在收入中，所以，在核定征收企業所得稅計算收入中，應不包含增值稅額。
　　另外，對小微企業月收入不達2萬元免增值稅，《財政部關于小微企業免征增值稅和營業稅的會計處理規定》(財會〔2013〕24號)規定，小微企業在取得銷售收入時，應當按照稅法的規定計算應交增值稅，并確認為應交稅費，在達到《財政部、國家稅務總局關于暫免征收部分小微企業增值稅和營業稅的通知》(財稅〔2013〕52號)規定的免征增值稅條件時，將有關應交增值稅轉入當期營業外收入。那么，核定征收企業所得稅的收入是否包含這部分營業外收入中的增值稅?筆者認為，應當包含。可判定為“補貼收入”，也可以判定為不滿足條件的“財政資金”。
　　還有一些納稅人咨詢：核定征收企業所得稅的企業處置固定資產時有“處置收入”，還有“凈收入”，如何確認計稅收入?企業所得稅法實施條例第十六條規定，所稱轉讓財產收入，指企業轉讓固定資產、生物資產、無形資產、股權和債權等財產取得的收入。從這個角度分析，核定征收企業所得稅的企業如果處置固定資產，應以處置收入作為計稅收入。